时空裂痕,时空小涵幸运方块
首先,我们得从基因组开始。现在我们都知道,每个生命,甚至病毒,都有自己的一套遗传信息。该遗传信息位于DNA 或RNA 上。然后对这些遗传信息进行测序和研究。研究信息的结构、功能和位置并试图对其进行修改的学科称为基因组学。时空组学是针对建筑物所有位置和所有时间段的详细施工计划。
通过量化单细胞中317 个基因的分布和丰度,展示了split-FISH 对小鼠各种组织(肾、肝、卵巢)的有效性,并揭示了复杂组织中转录组空间调控的不同定位模式。然后,为空间转录组学添加时间维度。比如在发育阶段,我们在1个月、2个月、3个月时观察心脏,结合不同时期的空间转录组信息来观察生命的发育过程。研究转录组在此过程中变化的学科就是时空组学,它的全称应该是时空转录组学。
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时空组学的意义在于,我们之前知道生命是根据遗传信息,即DNA来规划其生命活动的。然而,在什么时间段、什么位置,细胞按照什么规则工作。这部分信息是缺乏的,时空组学正在研究这个方向。如果患者的基因没有发生变化,那么一定有某种因素刺激了他的转录过程,导致一些治疗疾病的因子开始表达,时空组学可以尝试找到这种变化。
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Stereo-seq采用时空捕获芯片,结合原位RNA捕获,实现分辨率500 nm、最大捕获面积13 cm的技术,实现基因和图像的同步分析。高维:时空数据具有地理坐标和时间维度,因此具有高维的特点。至于时空组学的应用,从基础科学的角度来看,我们可以通过这项研究更多地了解生命本身的规律。
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为了快速、高效地传播和分享空间和单细胞多组学技术的发展和应用,华大基因推出时空/单细胞技术专题通讯。那么,同时检测同一生命或同一器官的不同位置的细胞的转录组信息就属于空间转录组学。同时检测同一生命或同一器官不同位置细胞的转录组信息属于空间组学。那么人类从事基因组学一段时间后,发现转录也很重要,所以就有了一个学科叫转录组学。
提出了一种将单细胞基因表达差异与空间背景相结合的新方法——sci-Space,能够在更大范围内解决空间异质性,同时保留单细胞分辨率。 Geo-seq 是一种结合了激光显微切割(LCM) 和scRNA-seq 的空间转录组技术,旨在分析感兴趣区域中少量(10) 个细胞的转录组信息,同时保留目标区域的原始位置。细胞。信息。